西元2199年,来(lái )自太阳系外的(de )敌人加米拉斯帝国,为了挽救母(mǔ )星的危亡,开始侵略其他星球。地(dì )球军在与加米拉斯帝国军的交(jiāo )战中惨败,同时加米拉斯帝国军(jun1 )向地球发射大量含有放射能的(de )游星炸弹。地球的抵抗力量越来(lái )越弱。本与加米(mǐ )拉斯为双子星球(qiú )的伊斯坎达尔(ěr )星球仗义相助,向(xiàng )地球发送了波(bō )动引擎和波动炮(pào )的设计图纸,并(bìng )告知地球军本星球拥有清除放(fàng )射能的设备“宇宙清洗器D”。在与欧(ōu )洲、美洲失去联系的情况下,地(dì )球防卫军利用伊斯坎达尔星球(qiú )提供的技术将沉睡于海底的大(dà )和号改造为宇(yǔ )宙战舰。大和号全(quán )体乘员踏上了(le )取回“宇宙清洗器(qì )D”的漫漫征程。