西元2199年,来(lái )自太阳系外的敌人加米拉斯帝(dì )国,为了挽救母(mǔ )星的危亡,开始侵(qīn )略其他星球。地(dì )球军在与加米拉(lā )斯帝国军的交(jiāo )战中惨败,同时加(jiā )米拉斯帝国军(jun1 )向地球发射大量(liàng )含有放射能的(de )游星炸弹。地球的(de )抵抗力量越来(lái )越弱。本与加米拉(lā )斯为双子星球(qiú )的伊斯坎达尔星球仗义相助,向(xiàng )地球发送了波动引擎和波动炮(pào )的设计图纸,并告知地球军本星(xīng )球拥有清除放(fàng )射能的设备“宇宙(zhòu )清洗器D”。在与欧(ōu )洲、美洲失去联(lián )系的情况下,地(dì )球防卫军利用伊(yī )斯坎达尔星球(qiú )提供的技术将沉(chén )睡于海底的大(dà )和号改造为宇宙(zhòu )战舰。大和号全(quán )体乘员踏上了取(qǔ )回“宇宙清洗器(qì )D”的漫漫征程。