西元2199年,来(lái )自太阳系外的敌人加米拉斯帝(dì )国,为了挽救母星的危亡,开始侵(qīn )略其他星球。地球军在与加米拉(lā )斯帝国军的交战中惨败,同时加(jiā )米拉斯帝国军(jun1 )向地球发射大量(liàng )含有放射能的(de )游星炸弹。地球的抵抗力量越来(lái )越弱。本与加米拉斯为双子星球(qiú )的伊斯坎达尔星球仗义相助,向(xiàng )地球发送了波动引擎和波动炮(pào )的设计图纸,并告知地球军本星(xīng )球拥有清除放射能的设备“宇宙(zhòu )清洗器D”。在与欧洲、美洲失去联(lián )系的情况下,地球防卫军利用伊(yī )斯坎达尔星球(qiú )提供的技术将沉睡于海底的大(dà )和号改造为宇宙战舰。大和号全(quán )体乘员踏上了取回“宇宙清洗器(qì )D”的漫漫征程。