西元2199年,来(lái )自太阳系外的敌(dí )人加米拉斯帝(dì )国,为了挽救母星(xīng )的危亡,开始侵(qīn )略其他星球。地球(qiú )军在与加米拉(lā )斯帝国军的交战中惨败,同时加(jiā )米拉斯帝国军向地球发射大量(liàng )含有放射能的(de )游星炸弹。地球的(de )抵抗力量越来(lái )越弱。本与加米拉(lā )斯为双子星球(qiú )的伊斯坎达尔星(xīng )球仗义相助,向(xiàng )地球发送了波动(dòng )引擎和波动炮(pào )的设计图纸,并告(gào )知地球军本星(xīng )球拥有清除放射(shè )能的设备“宇宙(zhòu )清洗器D”。在与欧洲(zhōu )、美洲失去联(lián )系的情况下,地球防卫军利用伊(yī )斯坎达尔星球提供的技术将沉(chén )睡于海底的大(dà )和号改造为宇宙(zhòu )战舰。大和号全(quán )体乘员踏上了取(qǔ )回“宇宙清洗器(qì )D”的漫漫征程。